Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms