Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms