Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms