Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms