Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM29Q5VYK3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms