Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC1Q5VXU3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms