Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms