Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms