Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms