Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms