Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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