Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms