Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms