Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms