Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms