Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
QSER1Q2KHR3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms