Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MICAQ29983 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MICAQ29983 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MICAQ29983 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MICAQ29983 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MICAQ29983 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICAQ29983 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICAQ29983 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICAQ29983 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICAQ29983 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICAQ29983 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICAQ29983 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICAQ29983 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms