Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDR2Q16832 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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