Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLFQ16534 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HLFQ16534 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLFQ16534 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLFQ16534 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLFQ16534 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLFQ16534 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLFQ16534 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLFQ16534 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLFQ16534 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLFQ16534 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLFQ16534 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLFQ16534 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLFQ16534 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLFQ16534 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HLFQ16534 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLFQ16534 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLFQ16534 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLFQ16534 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLFQ16534 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLFQ16534 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLFQ16534 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLFQ16534 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLFQ16534 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLFQ16534 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms