Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA4Q16363 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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