Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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