Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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