Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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