Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms