Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms