Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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