Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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