Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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SEMA3BQ13214 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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SEMA3BQ13214 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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