Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CNTN1Q12860 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CNTN1Q12860 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CNTN1Q12860 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CNTN1Q12860 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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CNTN1Q12860 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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CNTN1Q12860 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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CNTN1Q12860 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CNTN1Q12860 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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