Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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KCNMA1Q12791 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMA1Q12791 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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