Protein–RNA interactions for Protein: Q12734

CSR2, Transcription factor CSR2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSR2Q12734 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.24□□□□□ -2.21
CSR2Q12734 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt1.24□□□□□ -2.21
CSR2Q12734 STO1YMR125W 2586 nt1.24□□□□□ -2.21
CSR2Q12734 APL3YBL037W 3078 nt1.23□□□□□ -2.21
CSR2Q12734 PET127YOR017W 2403 nt1.23□□□□□ -2.21
CSR2Q12734 YNL211CYNL211C 261 nt1.23□□□□□ -2.21
CSR2Q12734 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.23□□□□□ -2.21
CSR2Q12734 YBR178WYBR178W 375 nt1.22□□□□□ -2.21
CSR2Q12734 ROM2YLR371W 4071 nt1.22□□□□□ -2.21
CSR2Q12734 EST2YLR318W 2655 nt1.21□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 SPT7YBR081C 3999 nt1.2□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.2□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.2□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 YOR102WYOR102W 351 nt1.2□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 NUP188YML103C 4968 nt1.2□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 RSM22YKL155C 1887 nt1.2□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 AZF1YOR113W 2745 nt1.19□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 CMC4YMR194C-B 222 nt1.19□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.18□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.18□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.18□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 SEC3YER008C 4011 nt1.18□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 WAR1YML076C 2835 nt1.18□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 MSN5YDR335W 3675 nt1.18□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 NOP9YJL010C 2001 nt1.17□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.17□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 EAF1YDR359C 2949 nt1.17□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 SMC1YFL008W 3678 nt1.16□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.16□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.16□□□□□ -2.22
CSR2Q12734 SNU13YEL026W 381 nt1.15□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.15□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 CDC39YCR093W 6327 nt1.14□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 TFB5YDR079C-A 219 nt1.14□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 PMP2YEL017C-A 132 nt1.14□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.13□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YLL020CYLL020C 306 nt1.13□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.13□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 ASE1YOR058C 2658 nt1.12□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 COX5BYIL111W 456 nt1.12□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YLR282CYLR282C 342 nt1.12□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YDL073WYDL073W 2955 nt1.12□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 STB6YKL072W 2301 nt1.11□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 BIR1YJR089W 2865 nt1.11□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YDR544CYDR544C 429 nt1.11□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YMR160WYMR160W 2451 nt1.11□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 BFR2YDR299W 1605 nt1.11□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 BUD3YCL014W 4911 nt1.11□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 GEA2YEL022W 4380 nt1.1□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 KAP120YPL125W 3099 nt1.1□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.1□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.1□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 PRP5YBR237W 2550 nt1.09□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 SEC21YNL287W 2808 nt1.09□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 RPL26BYGR034W 384 nt1.09□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 YBR099CYBR099C 384 nt1.09□□□□□ -2.23
CSR2Q12734 snR39BsnR39B 96 nt1.08□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 YML002WYML002W 2214 nt1.07□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 snR190snR190 190 nt1.07□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 UTP8YGR128C 2142 nt1.06□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 YGL182CYGL182C 324 nt1.06□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.06□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 YLR041WYLR041W 321 nt1.06□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 OST4YDL232W 111 nt1.05□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 RCO1YMR075W 2055 nt1.04□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 CHS6YJL099W 2241 nt1.04□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.04□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 PRP16YKR086W 3216 nt1.04□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 BEM2YER155C 6504 nt1.04□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 YMR326CYMR326C 309 nt1.03□□□□□ -2.24
CSR2Q12734 FYV10YIL097W 1551 nt1.02□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.02□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 NST1YNL091W 3723 nt1.02□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 SEC8YPR055W 3198 nt1.01□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 TAH1YCR060W 336 nt1.01□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 SOM1YEL059C-A 225 nt1.01□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 YHR217CYHR217C 462 nt1.01□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 YJR029WYJR029W 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 RAD9YDR217C 3930 nt0.99□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 snR61snR61 90 nt0.99□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 COG6YNL041C 2520 nt0.98□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.98□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.97□□□□□ -2.25
CSR2Q12734 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.96□□□□□ -2.26
CSR2Q12734 YLR232WYLR232W 348 nt0.95□□□□□ -2.26
CSR2Q12734 YDR210WYDR210W 228 nt0.94□□□□□ -2.26
CSR2Q12734 RPM2YML091C 3609 nt0.94□□□□□ -2.26
CSR2Q12734 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.92□□□□□ -2.26
CSR2Q12734 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.91□□□□□ -2.26
CSR2Q12734 VAM6YDL077C 3150 nt0.91□□□□□ -2.26
CSR2Q12734 SEC1YDR164C 2175 nt0.9□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 snR81snR81 201 nt0.89□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.89□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 SCC2YDR180W 4482 nt0.89□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.9 ms