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Protein–RNA interactions for Protein: Q12402
YOP1, Protein YOP1, yeast
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180 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
YOP1
Q12402
tT(AGU)I2
tT(AGU)I2
73 nt
0.49
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
tT(AGU)J
tT(AGU)J
73 nt
0.49
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
tT(AGU)N1
tT(AGU)N1
73 nt
0.49
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
tT(AGU)N2
tT(AGU)N2
73 nt
0.49
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
tT(AGU)O1
tT(AGU)O1
73 nt
0.49
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
tT(AGU)O2
tT(AGU)O2
73 nt
0.49
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
YBR182C-A
YBR182C-A
195 nt
0.49
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
YOR192C-B
YOR192C-B
5313 nt
0.49
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
YKU70
YMR284W
1809 nt
0.48
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
snR55
snR55
98 nt
0.48
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
PAU12
YGR294W
363 nt
0.48
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
YER181C
YER181C
324 nt
0.47
□□□□□ -2.33
YOP1
Q12402
YCR038W-A
YCR038W-A
126 nt
0.46
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
0.46
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
YIL002W-A
YIL002W-A
210 nt
0.46
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
NNF2
YGR089W
2811 nt
0.45
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
YSP1
YHR155W
3687 nt
0.45
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
SBH1
YER087C-B
249 nt
0.45
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
YDR366C
YDR366C
399 nt
0.44
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
YOL155W-A
YOL155W-A
135 nt
0.44
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
SNU13
YEL026W
381 nt
0.43
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
TRS65
YGR166W
1683 nt
0.41
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
YGL041C
YGL041C
204 nt
0.41
□□□□□ -2.34
YOP1
Q12402
APQ12
YIL040W
417 nt
0.4
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
ABF2
YMR072W
552 nt
0.4
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
YDR371C-A
YDR371C-A
105 nt
0.39
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
YGL188C-A
YGL188C-A
141 nt
0.39
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
RPS26A
YGL189C
360 nt
0.39
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
YML099W-A
YML099W-A
330 nt
0.39
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
MLP1
YKR095W
5628 nt
0.39
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
YIL142C-A
YIL142C-A
333 nt
0.38
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
YLL006W-A
YLL006W-A
177 nt
0.38
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
NIP1
YMR309C
2439 nt
0.38
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
UTP8
YGR128C
2142 nt
0.37
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
ORC3
YLL004W
1851 nt
0.36
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
YBR131C-A
YBR131C-A
90 nt
0.36
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
BUL2
YML111W
2763 nt
0.35
□□□□□ -2.35
YOP1
Q12402
PAM16
YJL104W
450 nt
0.34
□□□□□ -2.36
YOP1
Q12402
YLR232W
YLR232W
348 nt
0.34
□□□□□ -2.36
YOP1
Q12402
YOR302W
YOR302W
78 nt
0.33
□□□□□ -2.36
YOP1
Q12402
YBR072C-A
YBR072C-A
162 nt
0.32
□□□□□ -2.36
YOP1
Q12402
PRP39
YML046W
1890 nt
0.31
□□□□□ -2.36
YOP1
Q12402
snR80
snR80
171 nt
0.31
□□□□□ -2.36
YOP1
Q12402
YNL097C-B
YNL097C-B
123 nt
0.31
□□□□□ -2.36
YOP1
Q12402
TAH1
YCR060W
336 nt
0.3
□□□□□ -2.36
YOP1
Q12402
RCO1
YMR075W
2055 nt
0.29
□□□□□ -2.36
YOP1
Q12402
BIR1
YJR089W
2865 nt
0.27
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
ULP2
YIL031W
3105 nt
0.27
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
IQG1
YPL242C
4488 nt
0.26
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
snR8
snR8
190 nt
0.26
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
ANS1
YHR126C
480 nt
0.26
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
YBL039C-A
YBL039C-A
84 nt
0.26
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
GLG1
YKR058W
1851 nt
0.25
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
SDH6
YDR379C-A
240 nt
0.25
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
YDR544C
YDR544C
429 nt
0.25
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
YJL182C
YJL182C
318 nt
0.25
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
MYO1
YHR023W
5787 nt
0.25
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
YEL014C
YEL014C
306 nt
0.24
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
YEL073C
YEL073C
324 nt
0.24
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
YMR158W-B
YMR158W-B
321 nt
0.24
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
YBL100W-B
YBL100W-B
5313 nt
0.24
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
UTP20
YBL004W
7482 nt
0.22
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
YGL182C
YGL182C
324 nt
0.22
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.22
□□□□□ -2.37
YOP1
Q12402
MLP2
YIL149C
5040 nt
0.21
□□□□□ -2.38
YOP1
Q12402
YOR186C-A
YOR186C-A
210 nt
0.21
□□□□□ -2.38
YOP1
Q12402
COG6
YNL041C
2520 nt
0.2
□□□□□ -2.38
YOP1
Q12402
ESP1
YGR098C
4893 nt
0.2
□□□□□ -2.38
YOP1
Q12402
YMR160W
YMR160W
2451 nt
0.2
□□□□□ -2.38
YOP1
Q12402
CSE1
YGL238W
2883 nt
0.18
□□□□□ -2.38
YOP1
Q12402
YNL054W-B
YNL054W-B
5250 nt
0.18
□□□□□ -2.38
YOP1
Q12402
FMP27
YLR454W
7887 nt
0.17
□□□□□ -2.38
YOP1
Q12402
YOR314W-A
YOR314W-A
111 nt
0.15
□□□□□ -2.39
YOP1
Q12402
snR46
snR46
197 nt
0.15
□□□□□ -2.39
YOP1
Q12402
YOR381W-A
YOR381W-A
168 nt
0.14
□□□□□ -2.39
YOP1
Q12402
YBR099C
YBR099C
384 nt
0.12
□□□□□ -2.39
YOP1
Q12402
RPM2
YML091C
3609 nt
0.12
□□□□□ -2.39
YOP1
Q12402
YOR170W
YOR170W
306 nt
0.11
□□□□□ -2.39
YOP1
Q12402
SOV1
YMR066W
2697 nt
0.09
□□□□□ -2.39
YOP1
Q12402
snR52
snR52
92 nt
0.09
□□□□□ -2.4
YOP1
Q12402
HUG1
YML058W-A
207 nt
0.08
□□□□□ -2.4
YOP1
Q12402
YLR342W-A
YLR342W-A
174 nt
0.05
□□□□□ -2.4
YOP1
Q12402
YDR210W
YDR210W
228 nt
0.04
□□□□□ -2.4
YOP1
Q12402
YDR406W-A
YDR406W-A
246 nt
0.03
□□□□□ -2.4
YOP1
Q12402
EST1
YLR233C
2100 nt
0.03
□□□□□ -2.4
YOP1
Q12402
tM(CAU)Q2
tM(CAU)Q2
78 nt
0.02
□□□□□ -2.41
YOP1
Q12402
YPL060C-A
YPL060C-A
3315 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
YOP1
Q12402
YMR046W-A
YMR046W-A
129 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
YOP1
Q12402
YOR329W-A
YOR329W-A
210 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
YOP1
Q12402
snR48
snR48
113 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
YOP1
Q12402
SPG3
YDR504C
384 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
YOP1
Q12402
AI1
Q0050
2505 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
YOP1
Q12402
YKL145W-A
YKL145W-A
93 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
YOP1
Q12402
snR128
snR128
126 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
YOP1
Q12402
snR39B
snR39B
96 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
YOP1
Q12402
THO2
YNL139C
4794 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
YOP1
Q12402
YGR146C-A
YGR146C-A
162 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
YOP1
Q12402
JLP2
YMR132C
627 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
YOP1
Q12402
QCR9
YGR183C
201 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
YOP1
Q12402
YJL077W-A
YJL077W-A
87 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
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