Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.62□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.62□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 PRP42YDR235W 1635 nt0.62□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 HAL9YOL089C 3093 nt0.62□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.61□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 APQ12YIL040W 417 nt0.61□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 YLR041WYLR041W 321 nt0.61□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 UBP3YER151C 2739 nt0.59□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.58□□□□□ -2.32
TPT1Q12272 MYO1YHR023W 5787 nt0.58□□□□□ -2.32
TPT1Q12272 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.57□□□□□ -2.32
TPT1Q12272 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.55□□□□□ -2.32
TPT1Q12272 PET111YMR257C 2403 nt0.54□□□□□ -2.32
TPT1Q12272 SNU13YEL026W 381 nt0.53□□□□□ -2.32
TPT1Q12272 PAU12YGR294W 363 nt0.53□□□□□ -2.32
TPT1Q12272 UTP8YGR128C 2142 nt0.53□□□□□ -2.32
TPT1Q12272 TRS65YGR166W 1683 nt0.53□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 YEL014CYEL014C 306 nt0.51□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 ANS1YHR126C 480 nt0.51□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 NNF2YGR089W 2811 nt0.51□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 BEM3YPL115C 3387 nt0.5□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 YSP1YHR155W 3687 nt0.5□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 YJL182CYJL182C 318 nt0.49□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 PRP39YML046W 1890 nt0.49□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 SBH1YER087C-B 249 nt0.48□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 TAH1YCR060W 336 nt0.47□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 YLR232WYLR232W 348 nt0.47□□□□□ -2.33
TPT1Q12272 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.45□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 RPS26AYGL189C 360 nt0.45□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.45□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 ORC3YLL004W 1851 nt0.44□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 YDR544CYDR544C 429 nt0.44□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 PAM16YJL104W 450 nt0.44□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 NIP1YMR309C 2439 nt0.43□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.42□□□□□ -2.34
TPT1Q12272 YGL182CYGL182C 324 nt0.4□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 snR46snR46 197 nt0.4□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 BUL2YML111W 2763 nt0.39□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 snR52snR52 92 nt0.39□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 SDH6YDR379C-A 240 nt0.38□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.35□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 SPG3YDR504C 384 nt0.35□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.35□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 JLP2YMR132C 627 nt0.35□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.35□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 COG6YNL041C 2520 nt0.34□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 MLP1YKR095W 5628 nt0.34□□□□□ -2.35
TPT1Q12272 GLG1YKR058W 1851 nt0.34□□□□□ -2.36
TPT1Q12272 ULP2YIL031W 3105 nt0.33□□□□□ -2.36
TPT1Q12272 RCO1YMR075W 2055 nt0.33□□□□□ -2.36
TPT1Q12272 YEL073CYEL073C 324 nt0.32□□□□□ -2.36
TPT1Q12272 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.32□□□□□ -2.36
TPT1Q12272 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.31□□□□□ -2.36
TPT1Q12272 CSE1YGL238W 2883 nt0.31□□□□□ -2.36
TPT1Q12272 BIR1YJR089W 2865 nt0.31□□□□□ -2.36
TPT1Q12272 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.29□□□□□ -2.36
TPT1Q12272 YOR170WYOR170W 306 nt0.28□□□□□ -2.36
TPT1Q12272 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.27□□□□□ -2.37
TPT1Q12272 YJL150WYJL150W 303 nt0.27□□□□□ -2.37
TPT1Q12272 IQG1YPL242C 4488 nt0.24□□□□□ -2.37
TPT1Q12272 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.24□□□□□ -2.37
TPT1Q12272 YMR160WYMR160W 2451 nt0.23□□□□□ -2.37
TPT1Q12272 YDR210WYDR210W 228 nt0.23□□□□□ -2.37
TPT1Q12272 FMP27YLR454W 7887 nt0.23□□□□□ -2.37
TPT1Q12272 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.21□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.21□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.21□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 UTP20YBL004W 7482 nt0.21□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.2□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 HUG1YML058W-A 207 nt0.2□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 MLP2YIL149C 5040 nt0.19□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 YBR099CYBR099C 384 nt0.19□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 snR39BsnR39B 96 nt0.18□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 ESP1YGR098C 4893 nt0.17□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.17□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 snR48snR48 113 nt0.17□□□□□ -2.38
TPT1Q12272 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.15□□□□□ -2.39
TPT1Q12272 QCR9YGR183C 201 nt0.15□□□□□ -2.39
TPT1Q12272 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.15□□□□□ -2.39
TPT1Q12272 EST1YLR233C 2100 nt0.13□□□□□ -2.39
TPT1Q12272 YOR102WYOR102W 351 nt0.12□□□□□ -2.39
TPT1Q12272 SOV1YMR066W 2697 nt0.11□□□□□ -2.39
TPT1Q12272 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.1□□□□□ -2.39
TPT1Q12272 YNL198CYNL198C 303 nt0.1□□□□□ -2.39
TPT1Q12272 RPM2YML091C 3609 nt0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.5 ms