Protein–RNA interactions for Protein: Q12143

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1, yeastyeast

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSL1Q12143 RPS27BYHR021C 249 nt-1.11□□□□□ -2.59
NSL1Q12143 CSN9YDR179C 489 nt-1.12□□□□□ -2.59
NSL1Q12143 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.12□□□□□ -2.59
NSL1Q12143 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-1.13□□□□□ -2.59
NSL1Q12143 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-1.13□□□□□ -2.59
NSL1Q12143 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-1.13□□□□□ -2.59
NSL1Q12143 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-1.13□□□□□ -2.59
NSL1Q12143 CSE2YNR010W 450 nt-1.13□□□□□ -2.59
NSL1Q12143 YER053C-AYER053C-A 114 nt-1.14□□□□□ -2.59
NSL1Q12143 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-1.14□□□□□ -2.59
NSL1Q12143 YNL122CYNL122C 348 nt-1.16□□□□□ -2.6
NSL1Q12143 snR41snR41 95 nt-1.16□□□□□ -2.6
NSL1Q12143 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.19□□□□□ -2.6
NSL1Q12143 APQ12YIL040W 417 nt-1.2□□□□□ -2.6
NSL1Q12143 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-1.2□□□□□ -2.6
NSL1Q12143 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-1.2□□□□□ -2.6
NSL1Q12143 TOM22YNL131W 459 nt-1.2□□□□□ -2.6
NSL1Q12143 YGR069WYGR069W 336 nt-1.21□□□□□ -2.6
NSL1Q12143 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-1.22□□□□□ -2.6
NSL1Q12143 YDR544CYDR544C 429 nt-1.25□□□□□ -2.61
NSL1Q12143 YJL182CYJL182C 318 nt-1.25□□□□□ -2.61
NSL1Q12143 snR36snR36 182 nt-1.25□□□□□ -2.61
NSL1Q12143 COG6YNL041C 2520 nt-1.29□□□□□ -2.62
NSL1Q12143 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-1.31□□□□□ -2.62
NSL1Q12143 YGL052WYGL052W 306 nt-1.31□□□□□ -2.62
NSL1Q12143 YLR434CYLR434C 384 nt-1.31□□□□□ -2.62
NSL1Q12143 snR49snR49 165 nt-1.31□□□□□ -2.62
NSL1Q12143 TAH1YCR060W 336 nt-1.35□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 YNR025CYNR025C 360 nt-1.35□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 HMRA1YCR097W 381 nt-1.36□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-1.36□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-1.37□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 YDR048CYDR048C 315 nt-1.37□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 YER137W-AYER137W-A 306 nt-1.37□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-1.37□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-1.38□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-1.38□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.39□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-1.4□□□□□ -2.63
NSL1Q12143 YAF9YNL107W 681 nt-1.42□□□□□ -2.64
NSL1Q12143 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-1.42□□□□□ -2.64
NSL1Q12143 YGL182CYGL182C 324 nt-1.43□□□□□ -2.64
NSL1Q12143 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-1.43□□□□□ -2.64
NSL1Q12143 YOR170WYOR170W 306 nt-1.43□□□□□ -2.64
NSL1Q12143 snR161snR161 161 nt-1.43□□□□□ -2.64
NSL1Q12143 snR60snR60 104 nt-1.45□□□□□ -2.64
NSL1Q12143 YOR015WYOR015W 360 nt-1.45□□□□□ -2.64
NSL1Q12143 YML099W-AYML099W-A 330 nt-1.46□□□□□ -2.64
NSL1Q12143 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.47□□□□□ -2.64
NSL1Q12143 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-1.48□□□□□ -2.65
NSL1Q12143 snR78snR78 87 nt-1.49□□□□□ -2.65
NSL1Q12143 YDL158CYDL158C 309 nt-1.49□□□□□ -2.65
NSL1Q12143 YGL149WYGL149W 306 nt-1.49□□□□□ -2.65
NSL1Q12143 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-1.49□□□□□ -2.65
NSL1Q12143 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.53□□□□□ -2.65
NSL1Q12143 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-1.53□□□□□ -2.65
NSL1Q12143 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-1.54□□□□□ -2.66
NSL1Q12143 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-1.55□□□□□ -2.66
NSL1Q12143 YLR202CYLR202C 327 nt-1.57□□□□□ -2.66
NSL1Q12143 YOR121CYOR121C 306 nt-1.58□□□□□ -2.66
NSL1Q12143 snR69snR69 101 nt-1.6□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 YER090C-AYER090C-A 90 nt-1.6□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 snR74snR74 88 nt-1.61□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 YIL032CYIL032C 357 nt-1.61□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 JLP2YMR132C 627 nt-1.62□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 YNL266WYNL266W 420 nt-1.62□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 BIL1YOR304C-A 231 nt-1.62□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 snR50snR50 90 nt-1.62□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 YNL028WYNL028W 318 nt-1.63□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 ATP19YOL077W-A 207 nt-1.63□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 YNL324WYNL324W 396 nt-1.64□□□□□ -2.67
NSL1Q12143 YDR102CYDR102C 333 nt-1.66□□□□□ -2.68
NSL1Q12143 YKL063CYKL063C 504 nt-1.67□□□□□ -2.68
NSL1Q12143 YBR285WYBR285W 435 nt-1.67□□□□□ -2.68
NSL1Q12143 RDS3YPR094W 324 nt-1.71□□□□□ -2.68
NSL1Q12143 HTL1YCR020W-B 237 nt-1.72□□□□□ -2.68
NSL1Q12143 YFL032WYFL032W 321 nt-1.72□□□□□ -2.68
NSL1Q12143 ATP6Q0085 780 nt-1.73□□□□□ -2.69
NSL1Q12143 snR189snR189 189 nt-1.73□□□□□ -2.69
NSL1Q12143 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-1.74□□□□□ -2.69
NSL1Q12143 YER097WYER097W 330 nt-1.77□□□□□ -2.69
NSL1Q12143 SKI7YOR076C 2244 nt-1.78□□□□□ -2.69
NSL1Q12143 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-1.79□□□□□ -2.7
NSL1Q12143 snR67snR67 82 nt-1.81□□□□□ -2.7
NSL1Q12143 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.81□□□□□ -2.7
NSL1Q12143 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-1.81□□□□□ -2.7
NSL1Q12143 YNR077CYNR077C 255 nt-1.83□□□□□ -2.7
NSL1Q12143 YGL041CYGL041C 204 nt-1.85□□□□□ -2.71
NSL1Q12143 YGR035CYGR035C 351 nt-1.85□□□□□ -2.71
NSL1Q12143 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-1.88□□□□□ -2.71
NSL1Q12143 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-1.89□□□□□ -2.71
NSL1Q12143 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-1.9□□□□□ -2.71
NSL1Q12143 snR39BsnR39B 96 nt-1.9□□□□□ -2.71
NSL1Q12143 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-1.91□□□□□ -2.72
NSL1Q12143 YFL019CYFL019C 354 nt-1.92□□□□□ -2.72
NSL1Q12143 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.92□□□□□ -2.72
NSL1Q12143 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-1.94□□□□□ -2.72
NSL1Q12143 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.97□□□□□ -2.72
NSL1Q12143 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.97□□□□□ -2.72
NSL1Q12143 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-1.97□□□□□ -2.72
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