Protein–RNA interactions for Protein: Q12090

REX3, RNA exonuclease 3, yeast

Predictions only

Length 404 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REX3	Q12090	YOR161W-A	YOR161W-A	81 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
REX3	Q12090	SNU13	YEL026W	381 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
REX3	Q12090	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
REX3	Q12090	YFL063W	YFL063W	456 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
REX3	Q12090	YLR232W	YLR232W	348 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
REX3	Q12090	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
REX3	Q12090	YDR366C	YDR366C	399 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
REX3	Q12090	TAH1	YCR060W	336 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
REX3	Q12090	CSE1	YGL238W	2883 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
REX3	Q12090	snR60	snR60	104 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
REX3	Q12090	YEL073C	YEL073C	324 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
REX3	Q12090	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
REX3	Q12090	HTL1	YCR020W-B	237 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
REX3	Q12090	TFB5	YDR079C-A	219 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
REX3	Q12090	YLL019W-A	YLL019W-A	93 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
REX3	Q12090	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
REX3	Q12090	YDR157W	YDR157W	402 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
REX3	Q12090	YOR072W-B	YOR072W-B	162 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
REX3	Q12090	SOV1	YMR066W	2697 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
REX3	Q12090	YIL032C	YIL032C	357 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
REX3	Q12090	YMR193C-A	YMR193C-A	387 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
REX3	Q12090	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
REX3	Q12090	YDR210W	YDR210W	228 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
REX3	Q12090	YNL028W	YNL028W	318 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
REX3	Q12090	YGR069W	YGR069W	336 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
REX3	Q12090	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
REX3	Q12090	snR128	snR128	126 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
REX3	Q12090	GLG1	YKR058W	1851 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
REX3	Q12090	snR8	snR8	190 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
REX3	Q12090	YGR164W	YGR164W	336 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
REX3	Q12090	YDR102C	YDR102C	333 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	YGL149W	YGL149W	306 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	YBR099C	YBR099C	384 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	YER053C-A	YER053C-A	114 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	RAD61	YDR014W	1944 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	VAR1	Q0140	1197 nt		-0.32	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	snR46	snR46	197 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	YAF9	YNL107W	681 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
REX3	Q12090	SEC10	YLR166C	2616 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
REX3	Q12090	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
REX3	Q12090	HMRA1	YCR097W	381 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
REX3	Q12090	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
REX3	Q12090	SDH6	YDR379C-A	240 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
REX3	Q12090	Q0144	Q0144	330 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
REX3	Q12090	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
REX3	Q12090	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
REX3	Q12090	snR36	snR36	182 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
REX3	Q12090	APQ12	YIL040W	417 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
REX3	Q12090	EST1	YLR233C	2100 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
REX3	Q12090	YPR197C	YPR197C	564 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
REX3	Q12090	YOR015W	YOR015W	360 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
REX3	Q12090	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
REX3	Q12090	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
REX3	Q12090	ATP6	Q0085	780 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
REX3	Q12090	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
REX3	Q12090	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
REX3	Q12090	YIR030W-A	YIR030W-A	384 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
REX3	Q12090	YPR012W	YPR012W	255 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
REX3	Q12090	RPL39	YJL189W	156 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
REX3	Q12090	snR74	snR74	88 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
REX3	Q12090	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
REX3	Q12090	YGL052W	YGL052W	306 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
REX3	Q12090	YMR172C-A	YMR172C-A	384 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
REX3	Q12090	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
REX3	Q12090	YFL032W	YFL032W	321 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
REX3	Q12090	COG6	YNL041C	2520 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
REX3	Q12090	YFL019C	YFL019C	354 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
REX3	Q12090	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
REX3	Q12090	YDR544C	YDR544C	429 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
REX3	Q12090	snR33	snR33	183 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
REX3	Q12090	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
REX3	Q12090	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
REX3	Q12090	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
REX3	Q12090	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
REX3	Q12090	YKL118W	YKL118W	312 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
REX3	Q12090	YDR413C	YDR413C	576 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
REX3	Q12090	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
REX3	Q12090	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
REX3	Q12090	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
REX3	Q12090	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
REX3	Q12090	GIM4	YEL003W	336 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
REX3	Q12090	YER097W	YER097W	330 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
REX3	Q12090	YBR182C-A	YBR182C-A	195 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
REX3	Q12090	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
REX3	Q12090	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
REX3	Q12090	YGL182C	YGL182C	324 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
REX3	Q12090	YML099W-A	YML099W-A	330 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
REX3	Q12090	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
REX3	Q12090	YGL041C	YGL041C	204 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
REX3	Q12090	snR161	snR161	161 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
REX3	Q12090	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
REX3	Q12090	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
REX3	Q12090	YER181C	YER181C	324 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
REX3	Q12090	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
REX3	Q12090	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
REX3	Q12090	YOR170W	YOR170W	306 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
REX3	Q12090	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		-0.87	□□□□□ -2.55

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