Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD47Q08722 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms