Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 COX5BYIL111W 456 nt1.58□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 PMD1YER132C 5262 nt1.58□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 CDC25YLR310C 4770 nt1.57□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 snR61snR61 90 nt1.57□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 TAH1YCR060W 336 nt1.57□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 snR39BsnR39B 96 nt1.57□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 SEC3YER008C 4011 nt1.56□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 PAU12YGR294W 363 nt1.56□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.56□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 PAU24YBR301W 363 nt1.56□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 APL3YBL037W 3078 nt1.56□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 BST1YFL025C 3090 nt1.55□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 CLU1YMR012W 3834 nt1.55□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.55□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 STO1YMR125W 2586 nt1.54□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 YML002WYML002W 2214 nt1.53□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 PET127YOR017W 2403 nt1.52□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 MEC1YBR136W 7107 nt1.52□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.52□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 GEA2YEL022W 4380 nt1.52□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 SEC21YNL287W 2808 nt1.52□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 NOP9YJL010C 2001 nt1.51□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 HKR1YDR420W 5409 nt1.51□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 NUP145YGL092W 3954 nt1.5□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 LAA1YJL207C 6045 nt1.5□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 FYV10YIL097W 1551 nt1.5□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 EST2YLR318W 2655 nt1.5□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 MSN5YDR335W 3675 nt1.5□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 ASE1YOR058C 2658 nt1.49□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 WAR1YML076C 2835 nt1.49□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 FYV8YGR196C 2454 nt1.49□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 YLR041WYLR041W 321 nt1.48□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 NUP188YML103C 4968 nt1.48□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.47□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 snR190snR190 190 nt1.47□□□□□ -2.17
SGO1Q08490 KAP120YPL125W 3099 nt1.46□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.46□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.46□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.46□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 RCO1YMR075W 2055 nt1.46□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 SBH1YER087C-B 249 nt1.45□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 AZF1YOR113W 2745 nt1.44□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 YLR232WYLR232W 348 nt1.44□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 CDC39YCR093W 6327 nt1.44□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 IML1YJR138W 4755 nt1.44□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 PIK1YNL267W 3201 nt1.44□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 COG6YNL041C 2520 nt1.43□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.42□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.42□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.42□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.42□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.42□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.42□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.42□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 RPL26BYGR034W 384 nt1.42□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 PRP16YKR086W 3216 nt1.41□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 YDR210WYDR210W 228 nt1.41□□□□□ -2.18
SGO1Q08490 RPM2YML091C 3609 nt1.39□□□□□ -2.19
SGO1Q08490 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.38□□□□□ -2.19
SGO1Q08490 RAD9YDR217C 3930 nt1.38□□□□□ -2.19
SGO1Q08490 SEC1YDR164C 2175 nt1.33□□□□□ -2.2
SGO1Q08490 BIR1YJR089W 2865 nt1.32□□□□□ -2.2
SGO1Q08490 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.31□□□□□ -2.2
SGO1Q08490 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.31□□□□□ -2.2
SGO1Q08490 SEC8YPR055W 3198 nt1.31□□□□□ -2.2
SGO1Q08490 snR81snR81 201 nt1.29□□□□□ -2.2
SGO1Q08490 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.29□□□□□ -2.2
SGO1Q08490 YNL266WYNL266W 420 nt1.29□□□□□ -2.2
SGO1Q08490 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.28□□□□□ -2.2
SGO1Q08490 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.28□□□□□ -2.2
SGO1Q08490 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.27□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.27□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.26□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 SIP4YJL089W 2490 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 BEM3YPL115C 3387 nt1.25□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 YDL073WYDL073W 2955 nt1.24□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 NST1YNL091W 3723 nt1.23□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 UBP3YER151C 2739 nt1.22□□□□□ -2.21
SGO1Q08490 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.21□□□□□ -2.22
SGO1Q08490 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt1.19□□□□□ -2.22
SGO1Q08490 NNF2YGR089W 2811 nt1.19□□□□□ -2.22
SGO1Q08490 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.18□□□□□ -2.22
SGO1Q08490 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.18□□□□□ -2.22
SGO1Q08490 snR45snR45 172 nt1.18□□□□□ -2.22
SGO1Q08490 VAM6YDL077C 3150 nt1.17□□□□□ -2.22
SGO1Q08490 YSP1YHR155W 3687 nt1.16□□□□□ -2.22
SGO1Q08490 MYO1YHR023W 5787 nt1.15□□□□□ -2.22
SGO1Q08490 SPT7YBR081C 3999 nt1.15□□□□□ -2.23
SGO1Q08490 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.14□□□□□ -2.23
SGO1Q08490 BUD3YCL014W 4911 nt1.13□□□□□ -2.23
SGO1Q08490 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.4 ms