Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms