Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms