Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNB2Q08289 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB2Q08289 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms