Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms