Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 BLI1YKL061W 342 nt0.07□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 YDR102CYDR102C 333 nt0.06□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.06□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 YFL063WYFL063W 456 nt0.06□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.06□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 BUL2YML111W 2763 nt0.06□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 HTL1YCR020W-B 237 nt0.05□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 YGR069WYGR069W 336 nt0.04□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 COX12YLR038C 252 nt0.04□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 YLR041WYLR041W 321 nt0.04□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 SNU13YEL026W 381 nt0.03□□□□□ -2.4
NEJ1Q06148 YDR366CYDR366C 399 nt0.02□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.02□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YEL073CYEL073C 324 nt0.01□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.01□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.01□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 snR36snR36 182 nt0.01□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YKU70YMR284W 1809 nt0.01□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YER053C-AYER053C-A 114 nt0□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YNL028WYNL028W 318 nt0□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YOR015WYOR015W 360 nt0□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YGL149WYGL149W 306 nt-0.01□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-0.01□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-0.02□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YPR197CYPR197C 564 nt-0.02□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 SOV1YMR066W 2697 nt-0.03□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-0.03□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.03□□□□□ -2.41
NEJ1Q06148 YFL019CYFL019C 354 nt-0.05□□□□□ -2.42
NEJ1Q06148 YFL032WYFL032W 321 nt-0.06□□□□□ -2.42
NEJ1Q06148 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-0.06□□□□□ -2.42
NEJ1Q06148 YPR012WYPR012W 255 nt-0.06□□□□□ -2.42
NEJ1Q06148 snR74snR74 88 nt-0.07□□□□□ -2.42
NEJ1Q06148 ATP6Q0085 780 nt-0.07□□□□□ -2.42
NEJ1Q06148 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.08□□□□□ -2.42
NEJ1Q06148 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.08□□□□□ -2.42
NEJ1Q06148 YLR232WYLR232W 348 nt-0.09□□□□□ -2.42
NEJ1Q06148 HMRA1YCR097W 381 nt-0.1□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 RAD61YDR014W 1944 nt-0.11□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-0.11□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.11□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 snR45snR45 172 nt-0.11□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 CSE1YGL238W 2883 nt-0.12□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 YGL052WYGL052W 306 nt-0.12□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.13□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 YDR413CYDR413C 576 nt-0.13□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 APQ12YIL040W 417 nt-0.14□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-0.14□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 snR128snR128 126 nt-0.14□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 GLG1YKR058W 1851 nt-0.15□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 UTP8YGR128C 2142 nt-0.15□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 YBR099CYBR099C 384 nt-0.15□□□□□ -2.43
NEJ1Q06148 YDR544CYDR544C 429 nt-0.16□□□□□ -2.44
NEJ1Q06148 YER097WYER097W 330 nt-0.16□□□□□ -2.44
NEJ1Q06148 YKL118WYKL118W 312 nt-0.17□□□□□ -2.44
NEJ1Q06148 snR8snR8 190 nt-0.18□□□□□ -2.44
NEJ1Q06148 TAH1YCR060W 336 nt-0.19□□□□□ -2.44
NEJ1Q06148 RPL39YJL189W 156 nt-0.19□□□□□ -2.44
NEJ1Q06148 EST1YLR233C 2100 nt-0.2□□□□□ -2.44
NEJ1Q06148 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-0.22□□□□□ -2.44
NEJ1Q06148 GIM4YEL003W 336 nt-0.23□□□□□ -2.45
NEJ1Q06148 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.23□□□□□ -2.45
NEJ1Q06148 PRP39YML046W 1890 nt-0.23□□□□□ -2.45
NEJ1Q06148 COG6YNL041C 2520 nt-0.24□□□□□ -2.45
NEJ1Q06148 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-0.26□□□□□ -2.45
NEJ1Q06148 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-0.27□□□□□ -2.45
NEJ1Q06148 YGL041CYGL041C 204 nt-0.28□□□□□ -2.45
NEJ1Q06148 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-0.28□□□□□ -2.45
NEJ1Q06148 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.3□□□□□ -2.46
NEJ1Q06148 SBH2YER019C-A 267 nt-0.3□□□□□ -2.46
NEJ1Q06148 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-0.3□□□□□ -2.46
NEJ1Q06148 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-0.32□□□□□ -2.46
NEJ1Q06148 YDR210WYDR210W 228 nt-0.33□□□□□ -2.46
NEJ1Q06148 YML099W-AYML099W-A 330 nt-0.33□□□□□ -2.46
NEJ1Q06148 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.33□□□□□ -2.46
NEJ1Q06148 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-0.33□□□□□ -2.46
NEJ1Q06148 YGL182CYGL182C 324 nt-0.34□□□□□ -2.46
NEJ1Q06148 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-0.35□□□□□ -2.47
NEJ1Q06148 snR56snR56 88 nt-0.36□□□□□ -2.47
NEJ1Q06148 YEL014CYEL014C 306 nt-0.36□□□□□ -2.47
NEJ1Q06148 YGR164WYGR164W 336 nt-0.36□□□□□ -2.47
NEJ1Q06148 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.37□□□□□ -2.47
NEJ1Q06148 snR55snR55 98 nt-0.38□□□□□ -2.47
NEJ1Q06148 YER181CYER181C 324 nt-0.39□□□□□ -2.47
NEJ1Q06148 YJL182CYJL182C 318 nt-0.4□□□□□ -2.47
NEJ1Q06148 snR49snR49 165 nt-0.41□□□□□ -2.48
NEJ1Q06148 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.44□□□□□ -2.48
NEJ1Q06148 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.44□□□□□ -2.48
NEJ1Q06148 snR65snR65 100 nt-0.45□□□□□ -2.48
NEJ1Q06148 snR46snR46 197 nt-0.45□□□□□ -2.48
NEJ1Q06148 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.47□□□□□ -2.48
NEJ1Q06148 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.47□□□□□ -2.48
NEJ1Q06148 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.48□□□□□ -2.49
NEJ1Q06148 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.49□□□□□ -2.49
NEJ1Q06148 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.49□□□□□ -2.49
NEJ1Q06148 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.49□□□□□ -2.49
NEJ1Q06148 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.49□□□□□ -2.49
NEJ1Q06148 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.2 ms