Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms