Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR4Q05215 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms