Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3AQ05086 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms