Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

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Length 1,223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 KAP120YPL125W 3099 nt1.62□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.62□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 Q0143Q0143 153 nt1.6□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.6□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 FYV8YGR196C 2454 nt1.6□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 STB6YKL072W 2301 nt1.6□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 SEC8YPR055W 3198 nt1.59□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 CHS6YJL099W 2241 nt1.58□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 FYV10YIL097W 1551 nt1.58□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 RAD9YDR217C 3930 nt1.58□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 PRP16YKR086W 3216 nt1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 PET127YOR017W 2403 nt1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 GEA2YEL022W 4380 nt1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 CDC39YCR093W 6327 nt1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 TAH1YCR060W 336 nt1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q02979 YLR232WYLR232W 348 nt1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 YGR130CYGR130C 2451 nt1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 HKR1YDR420W 5409 nt1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.49□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.49□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.49□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.49□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.49□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.49□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.49□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.48□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 IML1YJR138W 4755 nt1.48□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.47□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.47□□□□□ -2.17
GDE1Q02979 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.46□□□□□ -2.18
GDE1Q02979 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.42□□□□□ -2.18
GDE1Q02979 OST4YDL232W 111 nt1.42□□□□□ -2.18
GDE1Q02979 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.42□□□□□ -2.18
GDE1Q02979 YSP1YHR155W 3687 nt1.41□□□□□ -2.18
GDE1Q02979 QCR9YGR183C 201 nt1.41□□□□□ -2.18
GDE1Q02979 snR85snR85 171 nt1.4□□□□□ -2.19
GDE1Q02979 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.4□□□□□ -2.19
GDE1Q02979 YNL205CYNL205C 423 nt1.37□□□□□ -2.19
GDE1Q02979 BEM3YPL115C 3387 nt1.36□□□□□ -2.19
GDE1Q02979 snR39BsnR39B 96 nt1.36□□□□□ -2.19
GDE1Q02979 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.35□□□□□ -2.19
GDE1Q02979 YPR117WYPR117W 7470 nt1.35□□□□□ -2.19
GDE1Q02979 UBP3YER151C 2739 nt1.34□□□□□ -2.19
GDE1Q02979 SOM1YEL059C-A 225 nt1.34□□□□□ -2.19
GDE1Q02979 NST1YNL091W 3723 nt1.34□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 COG6YNL041C 2520 nt1.33□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 PAU12YGR294W 363 nt1.33□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 PAU24YBR301W 363 nt1.33□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 SIP4YJL089W 2490 nt1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 YDR544CYDR544C 429 nt1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 YBR099CYBR099C 384 nt1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 YDL073WYDL073W 2955 nt1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 ULP2YIL031W 3105 nt1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q02979 SPT7YBR081C 3999 nt1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q02979 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q02979 YDR210WYDR210W 228 nt1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q02979 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q02979 SCC2YDR180W 4482 nt1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q02979 GLG1YKR058W 1851 nt1.25□□□□□ -2.21
GDE1Q02979 LTE1YAL024C 4308 nt1.24□□□□□ -2.21
GDE1Q02979 SEC1YDR164C 2175 nt1.24□□□□□ -2.21
GDE1Q02979 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q02979 VAM6YDL077C 3150 nt1.18□□□□□ -2.22
GDE1Q02979 DOP1YDR141C 5097 nt1.15□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 BIR1YJR089W 2865 nt1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 BEM2YER155C 6504 nt1.14□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 PMP2YEL017C-A 132 nt1.12□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 BUD3YCL014W 4911 nt1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 NNF2YGR089W 2811 nt1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.11□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q02979 snR61snR61 90 nt1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q02979 RKR1YMR247C 4689 nt1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q02979 YNL266WYNL266W 420 nt1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q02979 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q02979 YJR029WYJR029W 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q02979 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q02979 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q02979 BUL2YML111W 2763 nt1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q02979 TFB5YDR079C-A 219 nt1.01□□□□□ -2.25
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