Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC2Q02487 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms