Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms