Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms