Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms